Présentation de la société : CNRS
Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieure et de la Recherche. Créé en 1939 et dirigé par des scientifiques, il a pour mission de faire progresser la connaissance et être utile à la société dans le respect des règles d’éthique, de déontologie et d’intégrité scientifique.
Missions
Missions :
La mission de ce postdoctorat consiste à développer des solutions pour l’intégration de multiples modalités biologiques et à établir un lien entre le phénotype observé au microscope et les différentes mesures moléculaires de la cellule. Les méthodes seront validées sur des données de criblage à haut débit, incluant des images microscopiques ainsi que des données d’expression génétique et protéomique. Ce principe sera ensuite appliqué à l’élucidation de fonctions géniques encore inconnues.
Activités :
L’activité est principalement informatique. Elle concernera le développement de structure de modèles de réseaux de neurones profonds et leur entrainement. Elle consistera à étendre les résultats préliminaires que nous avons déjà obtenus dans le cadre de l’intégration de données d’imagerie microscopique avec des données transcriptomiques, grâce à la mise au point de variants de modèles de fusion de modalités.
Contexte de travail :
Le postdoctorat se déroulera à mi-temps au sein de l’équipe de bio imagerie computationnelle et bio-informatiques à l’IBENS, sous la direction d’Auguste Genovesio. Le/La postdoctorant.e aura accès à un poste de travail, ainsi qu’un accès à des serveurs de calculs équipés de GPUs.
Conditions particulières d'exercice
Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers) , en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.
Profil recherché
Competences :
Doctorat en informatique, apprentissage profond, sciences des données. Expérience avec des modèles multimodaux pour les données biologiques.
Contraintes et risques :
Aucun