Présentation de la société : CNRS
Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieure et de la Recherche. Créé en 1939 et dirigé par des scientifiques, il a pour mission de faire progresser la connaissance et être utile à la société dans le respect des règles d’éthique, de déontologie et d’intégrité scientifique.
Missions
Sujet de thèse :
La phosphorylation par les protéines kinases (PK) est une modification post-traductionnelle majeure qui influence presque tous les aspects de la biologie cellulaire. Les kinases sont présentes chez les eucaryotes, les procaryotes et les virus. Chez les eucaryotes, la branche la plus abondante des kinases dites « canoniques » montre qu’elles partagent des motifs de séquence et des structures 3D conservés dans leur domaine catalytique, et phosphorylent des résidus Ser, Thr ou Tyr dans leurs cibles protéiques. En revanche, les kinases atypiques partagent peu de similarité de séquence ou de structure 3D, et ne représentent qu’environ 10 % de toutes les kinases eucaryotes.
Nous avons fait la découverte fortuite qu’un virus géant, Pandoravirus dulcis, contient une kinase putative, auparavant annotée comme ORFan. La prédiction de structure par AlphaFold et la recherche d’homologues structuraux ont révélé que cette protéine contient des “motifs kinases” classiques, ainsi que des domaines supplémentaires de fonction inconnue. En utilisant cette kinase putative pour rechercher des homologues structuraux, nous avons identifié environ 15 kinases canoniques et non canoniques dans chaque souche de Pandoravirus.
Ce projet vise à élucider les détails moléculaires nécessaires à l’activité, à la régulation et aux interactions de ces kinases avec leurs partenaires, en adoptant une approche multidisciplinaire combinant biologie moléculaire, biochimie, biologie structurale, biophysique, et développement d’essais enzymatiques et de biocapteurs innovants. Nous espérons que ces études intégratives permettront d’identifier une nouvelle boîte à outils de signalisation par les kinases, incluant les kinases non canoniques, des motifs de phosphorylation originaux, de nouvelles fonctions et des mécanismes de régulation inédits, afin de permettre une compréhension globale de l’évolution des kinases chez les virus et au-delà.
Contexte :
Le poste se situe dans l'équipe “Biologie Structurale et Chimie-Biologie Intégrée” (iSCB) au sein du Centre de Recherche en Cancérologie de Marseille (CRCM) , Marseille. Le laboratoire CRCM est localisé à coté de l’Institut Paoli Calmettes et à proximité des campus Timone et Luminy de l’Université Aix-Marseille. La thématique de recherche de l'équipe est pluridisciplinaire: elle vise à identifier, comprendre et cibler les interactions protéine-protéine dans les voies de signalisation telles que la phosphorylation, en utilisant des approches de chimie, de biochimie, de biophysique, de biologie structurale et de criblage à haut débit et de chemoinformatique (plateforme HiTS) .
Conditions particulières d'exercice
Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers) , en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.
Profil recherché
Contraintes et risques :