CNRS : CONTRAT POSTDOCTORAL EN GÉNOMIQUE FONCTIONNELLE DES LNCRNAS DE MACRO ALGUES BRUNES (H/F)

Poste
Contractuel (27 mois) - Cadre
Niveau d'étude
Bac+8 (Doctorat)
Univers
Santé et Médecine
Localisation
(29, Finistere)

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Présentation de la société : CNRS

Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieure et de la Recherche. Créé en 1939 et dirigé par des scientifiques, il a pour mission de faire progresser la connaissance et être utile à la société dans le respect des règles d’éthique, de déontologie et d’intégrité scientifique.

Missions

Missions :
Contrat postdoctoral en génétique moléculaire des algues brunes

Les algues brunes (Phaeophyceae) , sont des macroalgues multicellulaires qui appartiennent au supergroupe eucaryote des Stramenopiles. Le projet ANR BrownLincs vise à approfondir la compréhension des processus moléculaires qui régissent le développement des algues brunes et l'acquisition de la multicellularité par l’analyse fonctionnelle du rôle régulateur des longs ARN non codants (lncRNAs) , des acteurs clés de la régulation cellulaire dans le domaine Eukarya.

Le candidat ou la candidate déploiera la méthodologie CRISPR pour générer des délétions de plusieurs loci lncRNA sélectionnés dans l’algue brune modèle Ectocarpus. Les phénotypes des mutants ainsi obtenus seront ensuite analysés au niveau morphologique et moléculaire, ce dernier impliquant à la fois une analyse transcriptomique et une analyse de la chromatine par une approche ChIP-seq.

Activités :
Le projet impliquera la maintenance et l’amplification de souches d'Ectocarpus de type sauvage et mutantes, l'application de la méthodologie CRISPR-Cas9 pour générer de nouvelles lignées mutantes et la caractérisation phénotypique de ces lignées mutantes. Le phénotypage utilisera une gamme d'approches différentes, incluant de la morphométrie, des approches de biologie cellulaire, et des approches transcriptomiques et épigénétiques. Des protocoles sont disponibles dans le laboratoire d'accueil pour toutes ces approches.
Contexte de travail :
L'institut d'accueil : La Station Biologique de Roscoff (SBR) est un centre de recherche en biologie marine et océanologie (http://www.sb-roscoff.fr/about-roscoff-marine-station/missions.html) . Il est situé dans la ville de Roscoff sur la côte nord de la Bretagne, à environ 60 km à l’est de Brest. Le personnel de la SBR comprend environ 200 employés permanents.
Le poste est financé par l'Agence nationale de la recherche, au travers du projet Brownlincs. Il inclura des interactions fortes avec l'Institut de Biologie de l’Ecole Normale Supérieure (IBENS; UMR 8197) à Paris et l’Institut Génétique & Développement de Rennes (IGDR; UMR 6290) à Rennes.

Conditions particulières d'exercice

Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers) , en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.

Profil recherché

Competences :
Le candidat ou la candidate devra maitriser des approches standard de biologie moléculaire, de biologie cellulaire (microscopie) et posséder une solide connaissance des techniques CRISPR et/ou une expérience de la culture des macroalgues. Des compétences bio-informatiques, par exemple la capacité à analyser des données transcriptomiques, serait également appréciée.
Contraintes et risques :
Pas de contrainte ni de risque spécifique